من كراماته عليه السلام روى جملة مها جماعة من أعلام العامة في مؤلفاتهم : فمنهم العلامة شهاب الدين أحمد بن محمد الحنفي في " تفسير آية المودة " ( ق 47 نسخة إسلامبول ) قال : وعن بعضهم : كنت بين مكة والمدينة فإذا أنا بشيخ يلوح في البرية فيظهر تارة ويغيب أخرى حتى قرب مني فسلم علي فرددت عليه السلام وقلت له : أين يا غلام ؟ قال : من الله ؟ . قلت : وإلى أين ؟ رجل عربي . فقلت : ابن لي . فقال : أنا رجل من قريش . فقلت : ابن لي عافاك الله . فقال : أنا رجل هاشمي . فقلت : ابن لي . فقال : أنا رجل علوي ، ثم أنشد يقول : نحن على الحوض رواده * نذود ويسعد وراده فما فاز من فاز إلا بنا * وما خاب من حبنا زاده فمن سرنا نال منا السرور * ومن ساءنا ساء ميلاده ومن كان غاصبنا حقنا * فيوم القيامة ميعاده ثم قال : أنا أبو جفر محمد بن علي بن الحسين بن علي بن أبي طالب ثم التفت فلم أره ولم أدر نزل في الأرض أو صعد إلى السماء .